Під час гонінь на християн благочестива вдова Юліанія ховалася від переслідувань з двома малолітніми дітьми Іоанном і Фимістією. Своїх дітей вона постійно вчила молитвам і читанню Священних Книг. Час від часу отрок Іоанн таємно відвідував ближню обитель, піддаючи себе небезпеці. Одного разу йому зустрівся благочестивий чоловік, який порадив знайти для молитов більш пустинне місце. Повернувшись додому, отрок сказав матері, що йде до одного благочестивого чоловіка. Думаючи, що син скоро повернеться, мати відпустила його. Іоанн вирушив до пустельника Фармуфія і, прийнявши від нього благословення, пішов у пустелю. Молодий подвижник знайшов порожній глибокий колодязь, в якому було багато змій, скорпіонів та інших гадів, і, помолившись, кинувся вниз, але, чудесно підтриманий Ангелом, залишився неушкодженим. На дні колодязя він провів у молитві з хрестоподібно складеними руками без їжі і сну сорок днів, поки змії не покинули колодязь. Одного разу Ангел, що приносив їжу пустельнику Фармуфію, приніс хліб і для святого Іоанна. Ангел не приносив хліб прямо Іоаннові, щоб юний подвижник не возгордився. З тих пір святий отрок отримував Небесну їжу через Фармуфія. Юному подвижнику довелося випробувати багато спокус від диявола. Біси приймали образ матері, сестри, родичів і знайомих святого Іоанна, щоб розжалобити подвижника і змусити його перервати подвиг. Всі вони з плачем по черзі підходили до колодязя, просячи преподобного Іоанна вийти до них. Весь цей час святий не припиняв молитви і після закінчення її вимовив: "Відійдіть від мене", - і біси зникли.
